Torque on cray

Для запуска многопоточной программы на сервере CRAY, на котором используется TORQUE необходимо создать PBS файл:

Необходимые переменные окружения также нужно грузить в pbs файле.
Для работы планировщика необходим модуль ALPS, модули можно загружать прямо из pbs файла (aprun зависит от модуля alps):
Загрузить модуль: module load alps
Список доступных модулей: module avail
Список загруженных модулей: module list
Замена модулей: module switch PrgEnv-cray PrgEnv-intel

Далее файл запускается командой:
qsub pbs.sh
Информация о работе модуля (в статусе должно быть Q или R):
qstat
Удаление задания:
qdel <номер из qstat>

GRADS grib1

step 1:

First of we need to install GRADS

http://grads.iges.org/grads/downloads.html

From the above link we can get the source.

In Ubuntu $ sudo apt-get install grads

step 2:

From the below site we can download the grib2ctl.pl perl source code
http://www.cpc.ncep.noaa.gov/products/wesley/grib2ctl.html

Look in the bottom of the page.

Try to open all the above links in firefox not in chrome.

Download that grib2ctl.pl source code from here ftp://ftp.cpc.ncep.noaa.gov/wd51we/wgrib.scripts/grib2ctl.pl use firefox.

save that file as grib2ctl.pl .

step 3:

Go to the below link to download the wgrib c code
http://www.cpc.ncep.noaa.gov/products/wesley/wgrib.html

From here you can download the wgrib.c source code ftp://ftp.cpc.ncep.noaa.gov/wd51we/wgrib/wgrib.c use firefox.

save it as wgrib.c.

$ gcc wgrib.c -o wgrib

We are generating the wgrib object file.

$ sudo cp wgrib /usr/local/bin/

We are moving that binary wgrib file in to the system path /usr/loca/bin

step 4:

Now open the grib2ctl.pl file,

  1. Look for the line:
    $wgrib=’wgrib’;
    and change it to point to your copy of wgrib. For example,
    $wgrib=’/usr/local/bin/wgrib’;
  2. (Optional) Look for the line:
    $pdef_dir=’/usr/local/lib/grads’;and change it to point to your grads directory. In the future, some unviewable grids (ex. thinned grids, native eta) will be handled by interpolation files.
  3. Don’t forget to make the program executable (chmod 755 grib2ctl.pl) and put it on your PATH. i.e $ sudo cp grib2ctl.pl /usr/local/bin/

Thats it … !

Now you can access the grib2ctl.pl from the bash shell (terminal) itself.

Try the following usage of grib2ctl with your analysis and forecasting binary grib files.

Usage

For analyses:

$ grib2ctl.pl grib_file >grib_file.ctl
$ gribmap -i grib_file.ctl -0 <– this is a zero
$ grads
Landscape mode? (no for portrait):

ga-> open grib_file.ctl

For forecasts:

$ grib2ctl.pl -verf grib_file >grib_file.ctl
$ gribmap -i grib_file.ctl

$ grads
Landscape mode? (no for portrait):
ga-> open grib_file.ctl